Deniz Müzesi,Türk Amirali Kaptan-ı Derya Barbaros Hayrettin Paşa’nın Beşiktaş’da(http://www.degisti.com/index.php/archives/2589) bulunan heykeli ve türbesi yanında yer alır. Türkiye’de kurulan ilk askeri müze olan Deniz Müzesi, aynı zamanda Türkiye’de denizcilik alanında kurulan en büyük müzedir. Deniz Kuvvetleri Komutanlığı’na  bağlı olan müze, içerdiği koleksiyon çeşitliliği bakımından dünyanın sayılı müzelerinden biridir.

Deniz Müzesi, 1897’de , Bahriye Nazırı Büyük Amiral Bozcaadalı Hasan Hüsnü Paşa’nın emri ile Kd. Yüzbaşı Süleyman Nutki tarafından,Tersane-i Amire’de (bugünkü Taşkızak Tersanesi) “Bahriye Müze ve Kütüphane İdaresi” ismiyle kurulmuştur. Önceleri düzenlemesi yapılmayan müze daha sonra Bahriye Nazırı Cemal Paşa tarafından görevlendirilen Deniz Yüzbaşı Ali Sami Boyer tarafından bilimsel anlamda düzenlenmiştir.

II.Dünya Savaşı sırasında,müzedeki eserler korunma amacıyla Anadoluya nakledilmiş;savaş bitince 1946’da müzenin tekrar İstanbul’a taşınmasına karar verilmiştir. Dolmabahçe Külliyesi’ne taşınan müze,iki yıllık bir çalışma sonunda 27 Eylül 1948 yılında ziyarete açılmıştır.1961 yılında müze Beşiktaş’a,bugünkü bulunduğu yere taşınmıştır.

Müzenin ana sergi binasında 4 salon ve 17 odada,eserler yer almaktadır. Ana sergi binası,1500 metrekare alana sahip,üç katlı bir yapıdır.Müzenin eski saltanat kayıkları bölümü 1970 yılında ziyarete açılmıştır. Bunun dışında müzede,haritalar,sancaklar,gemi modelleri,bahriyeli kıyafetleri,kadırgalar,tuğralar,armalar,seyir aletleri,silahlar ve tablolar sergilenmektedir.

Eski Beşiktaş Astro Türk Tütün Deposu’nun yıkılıp(http://www.degisti.com/index.php/archives/2559) ,yerine bir otel inşaasına başlanması sırasında, hemen yanında yer alan Deniz Müzesi’de bu durumdan etkilenmiştir, ki müze de bir süredir onarımdadır…

Beşiktaş Deniz Müzesi, beş yıl süren restorasyonun ardından 04.10.2013’de resmi olarak açılmıştır.